ในแง่ของการใช้งาน สามารถแบ่งง่ายๆ ออกเป็นสองประเภท ได้แก่ กล้องเอนโดสโคปสำหรับอุตสาหกรรม และกล้องเอนโดสโคปทางการแพทย์
สำหรับประเภทของกล้องเอนโดสโคปทางอุตสาหกรรม พวกมันแบ่งออกเป็น: กล้องเอนโดสโคปแบบออปติคอล, กล้องเอนโดสโคปไฟเบอร์ออปติก, กล้องเอนโดสโคปอิเล็กทรอนิกส์, กล้องเอนโดสโคปวิดีโอ CCD, กล้องเอนโดสโคปวิดีโอ CMOS และกล้องเอนโดสโคปแบบไฟฟ้า 360 องศา จากประเภทของแหล่งกำเนิดแสงเอนโดสโคป แบ่งออกเป็นเอนโดสโคปหลอดฟลูออเรสเซนต์ความถี่สูง เอนโดสโคปหลอดฮาโลเจนไฟเบอร์ออปติก เอนโดสโคป LED
เกี่ยวกับการจำแนกประเภทกล้องเอนโดสโคปทางการแพทย์ สามารถแบ่งคร่าวๆ ออกเป็นสามประเภทตามการพัฒนาและโครงสร้างภาพ: กล้องเอนโดสโคปแบบท่อแข็ง กล้องเอนโดสโคปแบบใยแก้วนำแสง (แบบท่อ) และกล้องเอนโดสโคปแบบอิเล็กทรอนิกส์
กล้องเอนโดสโคปสำหรับการตรวจทางการแพทย์มีหลายประเภท และวิธีการจำแนกประเภทก็แตกต่างกัน โดยทั่วไป วิธีการจัดประเภทสามวิธีต่อไปนี้เป็นเรื่องปกติมากกว่า ในแง่ของการขายในตลาด หมวดหมู่ที่ใช้มากที่สุดในปัจจุบันแบ่งออกเป็นสองประเภท: กระจกแข็งและกระจกอ่อนยืดหยุ่นตามว่าสามารถเปลี่ยนทิศทางทางคลินิกได้หรือไม่
โดยฟังก์ชันเอนโดสโคป
แบ่งเป็นกระจกบานเดียวและกระจกหลายบาน กระจกแบบฟังก์ชันเดียวหมายถึงกระจกสังเกตการณ์ที่ไม่มีช่องสัญญาณทำงานและมีระบบออปติกเท่านั้น กระจกอเนกประสงค์หมายถึงกระจกสังเกตการณ์ที่มีช่องการทำงานอย่างน้อยหนึ่งช่องบนตัวกระจกตัวเดียวกัน และมีหน้าที่ให้แสงสว่าง การผ่าตัด การล้างและอื่นๆ สถานที่น่าสนใจและฟังก์ชั่นอื่นๆ
ตามตำแหน่งที่กล้องเอนโดสโคปเข้าถึงได้
จำแนกตามส่วนต่าง ๆ ที่กล้องเอนโดสโคปเข้าถึงได้: แบ่งออกเป็นกล้องเอนโดสโคป ENT, กล้องเอนโดสโคปในช่องปาก, กล้องเอนโดสโคปทางทันตกรรม, ประสาทสโคป, ซิสโตสโคปท่อปัสสาวะ, รีเซกโตสโคป, ลาพาโรสโคป, อาร์โทรสโคป, กระจกไซนัส, กล่องเสียง ฯลฯ
ขึ้นอยู่กับว่าตัวกระจกสามารถเปลี่ยนทิศทางได้หรือไม่
ในทางคลินิก จำแนกตามร่างกายของกล้องเอนโดสโคปว่าสามารถเปลี่ยนทิศทางได้หรือไม่: แบ่งออกเป็น 2 ประเภท ได้แก่ กระจกแข็งและกระจกอ่อนยืดหยุ่น กระจกแข็ง (RIGID ENDOSCOPE) เป็นระบบออปติกปริซึม ข้อได้เปรียบที่ใหญ่ที่สุดคือการถ่ายภาพที่ชัดเจน สามารถติดตั้งช่องการทำงานหลายช่อง และเลือกมุมมองได้หลายมุม FLEXIBLE ENDOSCOPE เป็นระบบใยแก้วนำแสง คุณสมบัติที่ใหญ่ที่สุดของกล้องเอนโดสโคปไฟเบอร์ออปติกนี้คือส่วนเลนส์สามารถถูกควบคุมโดยผู้ปฏิบัติงานเพื่อเปลี่ยนทิศทางและขยายขอบเขตการใช้งาน อย่างไรก็ตาม เอฟเฟ็กต์การถ่ายภาพไม่ดีเท่ากล้องเอนโดสโคปแบบแข็ง
